CUSHUROmics – revelando la taxonomía, filogenia y metabolismo de los microorganismos que forman un alimento peruano ancestral mediante herramientas ómicas

Abstract

El cushuro es un alimento formado por colonias globulares de cianobacterias fijadoras de nitrógeno del género Nostoc. Este proyecto tiene como objetivo estudiar la taxonomía, relaciones evolutivas y capacidades metabólicas potenciales de los microorganismos que forman este alimento mediante herramientas genómicas. Para ello, se empleará secuenciación masiva de amplicones largos con tecnología de tercera generación (Nanopore) para caracterizar la composición taxonómica del Nostoc que forma la matriz de las colonias y de los microorganismos asociados (litósfera). Los genomas serán obtenidos mediante secuenciación masiva de segunda (Illumina) y tercera generación, estableciendo relaciones evolutivas en un marco de filogenómica que complementará el análisis de amplicones. Se realizará la anotación de los genomas para predecir rutas metabólicas potenciales, incluyendo fotosíntesis, fijación biológica de nitrógeno, producción de metabolitos secundarios y exopolisacáridos (EPS), cuya caracterización permitirá relacionar sus propiedades con las rutas de biosíntesis. La fijación de nitrógeno será verificada experimentalmente mediante la técnica ARA. Finalmente, se llevará a cabo un análisis transcriptómico y metabolómico para explorar los mecanismos utilizados por el Nostoc del cushuro para tolerar la desecación durante la época seca y reactivar su metabolismo en la rehidratación durante la época de lluvias.