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dc.contributor.advisorMansilla Samaniego, Roberto Carlos
dc.contributor.advisorQuispe Apaza, Cinthia Sheila
dc.contributor.authorVillanueva Cáceda, Juan José
dc.date.accessioned2018-11-05T15:15:16Z
dc.date.available2018-11-05T15:15:16Z
dc.date.issued2018
dc.identifier.otherF30.V543-T BAN UNALM
dc.identifier.urihttp://repositorio.lamolina.edu.pe/handle/UNALM/3621
dc.descriptionUniversidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biologíaes_PE
dc.description.abstractSe estudió la diversidad genética del patógeno Hemilia vastatrix por medio del análisis de la región ITS del ADN ribosomal. La extracción del ADN se realizó con el protocolo descrito por Goodwin y Lee (1993) y Cristancho et al. (2007) con algunas modificaciones, a partir de uredosporas aisladas de hojas infectadas de Coffea arabica, las que fueron seleccionadas al azar en cinco fincas localizadas en la zona productora de Quillabamba (Región Cusco). La amplificación de la región ITS se realizó mediante la técnica de PCR, los fragmentos obtenidos fueron separados utilizando electroforesis en gel de agarosa al uno por ciento. La purificación desde el gel del producto de amplificación se realizó utilizando el kit “QIAquick gel extraction”. La clonación de dicho fragmento se logró por transformación de una cepa de E. coli competente empleando el kit “pGEM®-T Easy Vector Systems” (PROMEGA). El aislamiento de las colonias transformadas se realizó en el medio LB más ampicilina. Para la extracción del plásmido de la bacteria se utilizó el kit “Wizard®Plus SV Minipreps DNA Purification System”. Los plásmidos obtenidos fueron enviados a GenBioteck (Argentina) para su secuenciación. A partir de 49 secuencias se identificaron 38 haplotipos (h=38), con diversidad haplotípica (Hd=0.977 ± 0.012), diversidad nucleotídica (π=0.0054 ± 0.00038) e índice de Tajima (D = -2.35287, p<0.01). Los resultados sugieren que H. vastatrix es una población que está en crecimiento con una alta proporción de haplotipos únicos.es_PE
dc.description.abstractThe genetic diversity of the pathogen Hemileia vastatrix was studied by analyzing ITS region of the ribosomal DNA. The extraction of the DNA was done by following the protocol described by Goodwin and Lee (1993) and Cristancho et al. (2007) with certain deviations, the uredospores were isolated from the infected leaves of the Coffea spp., these were random chosen from five farm located in the productive zone of Quillabamba (Cusco Region). The amplification of the ITS region was done by the PCR technique, and the fragments obtained were separated by electrophoresis in agarose gel at one percent. The purification of the amplification’s product was made by utilizing the QIAquick gel extraction kit following the manual. The cloning was realized by transforming an competent strain of the E. coli using the pGEM®-T Easy Vector Systems (PROMEGA) kit. The isolation of the transformed colonies was done in a LB medium with ampicillin. For the extraction of the plasmid from the bacteria the Wizard®Plus SV Minipreps DNA purification system was used. For the sequencing the obtained plasmid was sent to GenBioteck (Argentina). From 49 sequences 38 haplotypes (h = 38) were identified, resulting haplotype diversity (Hd = 0.977 ± 0.012), nucleotide diversity (π = 0.0054 ± 0.00038) and index of Tajima (D = -2.35287, p<0.01). The results suggest that H. vastatrix is a population that is growing with a high proportion of unique haplotypes.en_US
dc.description.uriTesises_PE
dc.formatapplication/pdfen_US
dc.language.isospaes_PE
dc.publisherUniversidad Nacional Agraria La Molinaes_PE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.sourceUniversidad Nacional Agraria La Molinaes_PE
dc.sourceRepositorio institucional - UNALMes_PE
dc.subjectCoffea Arabicaes_PE
dc.subjectHemileia vastatrixes_PE
dc.subjectVariación genéticaes_PE
dc.subjectAdn ribosomales_PE
dc.subjectHongos patógenoses_PE
dc.subjectAnálisis biológicoes_PE
dc.subjectPerúes_PE
dc.subjectEspaciadores transcribibles internoses_PE
dc.subjectItses_PE
dc.subjectDiversidad genéticaes_PE
dc.subjectQuillabamba (cap prov)es_PE
dc.subjectLa Convención (prov)es_PE
dc.titleAnálisis de la diversidad genética de Hemileia vastatrix de Quillabamba mediante secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomales_PE
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisen_US
thesis.degree.disciplineBiologíaes_PE
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Cienciases_PE
thesis.degree.nameBiólogoes_PE
thesis.degree.levelTítulo Profesionales_PE
dc.subject.ocdehttp://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07es_PE


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