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dc.contributor.advisorEspejo Joya, Rosa
dc.contributor.advisorBernacchia, Giovanni
dc.contributor.authorMansilla Samaniego, Roberto Carlos
dc.date.accessioned2021-11-25T17:36:13Z
dc.date.available2021-11-25T17:36:13Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12996/5081
dc.descriptionUniversidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Doctorado en Ciencias e Ingeniería Biológicases_PE
dc.description.abstractEl café, el principal producto agrícola de exportación tradicional del Perú, está amenazado por los efectos que se preveé ocasione el cambio climático, porque su calidad organoléptica y productividad dependen de las condiciones ambientales. Sin embargo, la forma de como se realiza la respuesta genética a las temperaturas elevadas es aun desconocida. En tal sentido, la presente tesis tuvo como objetivo analizar el efecto de la elevación de la temperatura del aire sobre el transcriptoma de dos accesiones de cafetos (Coffea arabica) del fundo Santa Teresa de Villa Rica – Perú. Para lo cual se ha realizado el análisis de la expresión génica diferencial. Primero, a través, del análisis de diversidad genética y estructura poblacional mediante marcadores moleculares SRAPs y microsatélites, se establecieron las diferencias genómicas y se determinaron las accesiones de cafetos a analizar. Luego mediante análisis RTqPCR se establecieron dos genes (HSF30 con sus dos variantes XM_027209958.1 y XM_027228927.1; y el HSFA6b) como marcadores de respuesta de la expresión genética frente a la elevada temperatura del aire, los que permitieron determinar que la condición de 45ºC por 90 minutos es la óptima para el análisis transcripcional. En el análisis de la expresión génica diferencial mediante RNAseq, utilizando la plataforma Illumina para la secuenciación, se estableció que el número de genes diferencialmente expresados fueron 721 y 696 para las accesiones BorA y Cat, respectivamente (LFD > 10 y s-value < 0.01), de los cuales, 118 genes sobrexpresados y 95 subexpresados son compartidos por ambas accesiones. Finalmente, se observó que las familias de los genes HSP20 y HSP70, y de las variantes del factor de transcripción HSFA2 fueron las de mayor expresión para ambas accesiones, las cuales estarían expresándose como respuesta al estrés elevadas temperaturas del aire y relacionadas a la termotolerancia adquirida.es_PE
dc.description.abstractCoffee is the principal traditional agricultural export product of Peru, however, this crop is being threatened by the effects of climate change, because its organoleptic quality and productivity are strongly dependent on environmental conditions such as the air temperature. In this sense, the goal of the thesis was to analyze the response to the air temperatura elevation in two genotypes of a Coffea arabica Peruvian collection from Santa Teresa estate of Villa Rica - Peru by transcriptome analysis. Firstly, the genomic differences between the accessions of the germplasm collection of the Santa Teresa estate, located in Villa Rica, were established by genetic diversity and population structure analysis using molecular markers SRAPs and microsatellites. This analysis identified six genomic groups of C. arabica in the collection. Then, two heat stress-related marker genes (the HSF30 gene with two variants XM_027209958.1 and XM_027228927.1, and the HSFA6b gene) were found by RTqPCR analysis and analyzed to establish the optimal time to perform the transcriptional analysis: 45ºC for 90 minutes. Finally, the differential analysis of whole gene expression was performed in two genomically different accessions by RNAseq, using Illumina platform. In this analysis, 721 and 696 genes (LFD> 10 and s value <0.01) were differentially expressed in BorA and Cat accessions, respectively. Furthermore, 118 overexpressed and 95 underexpressed genes were shared by both accessions. Likewise, the gene families HSP20 and HSP70, and the gene variants of transcriptional factor HSFA2 were the highest expressed in both accessions upon heat stress. This would suggest that these genes might be involved in acquired thermotolerance.en_US
dc.formatapplication/pdfen_US
dc.language.isospaes_PE
dc.publisherUniversidad Nacional Agraria La Molinaes_PE
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectCoffea arabicaes_PE
dc.subjectTemperatura del airees_PE
dc.subjectTemperatura ambientales_PE
dc.subjectRespuesta de la plantaes_PE
dc.subjectExpresión génicaes_PE
dc.subjectBiotecnología vegetales_PE
dc.subjectGeneses_PE
dc.subjectExperimentación en laboratorioes_PE
dc.subjectPerúes_PE
dc.subjectCafées_PE
dc.subjectRT-PCRes_PE
dc.subjectRT-QPCRes_PE
dc.subjectTécnicas moleculareses_PE
dc.titleTranscriptoma de Cafetos (Coffea arabica L.) cultivados en el Perú como respuesta a la elevación de la temperatura del airees_PE
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisen_US
thesis.degree.disciplineCiencias e Ingeniería Biológicases_PE
thesis.degree.grantorUniversidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgradoes_PE
thesis.degree.nameDoctoris Philosophiae - Ciencias e Ingeniería Biológicases_PE
dc.subject.ocdehttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07es_PE
renati.author.dni21124314es_PE
dc.publisher.countryPEes_PE
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionen_US
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-3436-7516es_PE
renati.advisor.orcidhttps://orcid.org/0000-0002-3259-7273es_PE
renati.advisor.dni08393866es_PE
renati.advisor.pasaporteYA4379666es_PE
renati.typehttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesises_PE
renati.levelhttps://purl.org/pe-repo/renati/level#doctores_PE
renati.discipline511018es_PE
renati.jurorJiménez Dávalos, Jorge
renati.jurorBlas Sevillano, Raúl
renati.jurorVillena Chávez, Gretty
renati.jurorGonzalez Fortes, Gloria María


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